El continuo desarrollo de nuevas drogas y combinaciones de tratamientos, ha generado un intenso interés en la identificación de biomarcadores predictores de la respuesta y toxicidad al tratamiento. A nivel mundial, en pacientes con diagnóstico de cáncer colorrectal (CCR) que presentan estadios clínicos (EC) avanzados de enfermedad, la tasa de supervivencia a los 5 años es del 33.4 % (EC-IIIc) al 6.0 % (EC-IV), niveles inferiores en nuestra población. El pronóstico de los pacientes cuyos tumores presentan ciertas alteraciones moleculares, y son tratados con terapias específicas, es más favorable al de la población general. Sin embargo, el desbalance del equilibrio de la microbiota intestinal puede provocar la inducción de un estado inflamatorio crónico capaz de modular las funciones de las células inmunes en el microambiente tumoral, lo cual afecta la eficacia del tratamiento y puede bloquear o potenciar la acción de la droga. Así, el presente proyecto buscará entender el efecto de la composición de la microbiota intestinal en la tumorogenesis del CCR. Se evaluará el conjunto de alteraciones moleculares características del tumor en CCR y la composición de la microbiota intestinal propia de la población peruana de forma integrativa para, así, definir biomarcadores pronósticos de enfermedad, predictivos de tratamiento y de eventos adversos, con los que los pacientes peruanos puedan beneficiarse. De este modo se busca ampliar el conocimiento de la enfermedad y poder combinar los tratamientos oncológicos con la modulación de la microbiota, con lo que se podrá llegar a implementar los transplantes de microbiota. Esta información abrirá nuevas vías para la prevención y estrategias terapéuticas en pacientes con cáncer. El proyecto será realizado en conjunto entre el Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN) y la Universidad Científica del Sur.

La presión actual por seleccionar el mejor tratamiento para cada paciente de forma individualizada, mediante el empleo de nuevas drogas y combinaciones de tratamientos, ha generado un intenso interés en la identificación de biomarcadores que funcionen como predictores del pronóstico de la enfermedad, de la respuesta y toxicidad al tratamiento para que los pacientes presenten menos eventos adversos y tengan una mejor calidad y mayor esperanza de vida. El pronóstico de los pacientes cuyos tumores presentan ciertas alteraciones moleculares, y son tratados con terapias específicas, es más favorable al de la población general. Estas alteraciones consisten principalmente en defectos en mecanismos de reparación del DNA y mutaciones somáticas en uno o más genes. La microbiota intestinal es capaz de modular las funciones de las células inmunes en el microambiente tumoral, lo cual afecta la eficacia del tratamiento y puede bloquear o potenciar la acción de la droga en pacientes con diagnóstico de CCR.

Es claro y necesario entender cómo la inflamación y los mecanismos del sistema inmune son dependientes de la microbiota en CCR. De este modo, el proyecto tratará de entender el efecto de la composición de la microbiota intestinal en la tumorogenesis del CCR, así como su efecto en los tratamientos en relación a las características y alteraciones moleculares presentes en las células del tumor. Debido a la alta prevalencia de bacterias endémicas en la población peruana, se hace crucial la pregunta de cómo la microbiota está afectando a los pacientes peruanos de CCR y si los biomarcadores moleculares que hoy se emplean en la rutina de la práctica clínica son suficientes o se ven alterados dependiendo del perfil de la mirobiota intestinal. El proyecto será realizado en conjunto entre los Departamentos de Medicina Oncológica y Cirugía de Abdomen del Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN) y la Universidad Científica del Sur.

En Perú, el Cáncer Colorrectal (CCR) corresponde al cuarto cáncer más común, lo cual representa 3,000 nuevos casos y 1,800 muertes en 2012. A pesar de los avances en el diagnóstico y tratamiento, una gran proporción de pacientes CCR que sufren resección quirúrgica como tratamiento con intención curativa presentan progresión de la enfermedad. En el caso de pacientes con tumores irresecables o metastáticos, la tasa de supervivencia a los 5 años es del 33.4 % y 6.0 % respectivamente.

El continuo desarrollo de nuevas drogas y combinaciones de tratamientos ha generado un intenso interés en la identificación de biomarcadores como predictores de la respuesta y toxicidad al tratamiento. El pronóstico de los pacientes cuyos tumores presentan ciertas alteraciones moleculares y son tratados con terapias específicas, es más favorable al de la población general. Aproximadamente el 16 % de los casos de CCR tiene defectos en mecanismos de reparación del DNA debido a las altas frecuencias inestabilidad microsatelital (MSI), elevada carga mutacional (TMB) y/o mutaciones somáticas en uno o más genes como KRAS, P53 POLE, BRAF, PIK3CA y PTEN. A su vez, el desbalance del equilibrio de la microbiota intestinal puede provocar la inducción de un estado inflamatorio crónico que promueva la proliferación celular y, con ello, afecte a la respuesta inmune capaz de causar daño en el DNA de las células del epitelio intestinal, con lo cual se crean las condiciones para la inducción de la tumorogénesis en la mucosa intestinal. Al respecto, diferentes estudios han encontrado especies de bacterias que se encuentran enriquecidas en, específicamente, pacientes con diagnóstico de CCR. Estas son capaces de modular las funciones de las células inmunes en el microambiente tumoral, lo cual perjudica la eficacia del tratamiento y puede bloquear o potenciar la acción de la droga. Es claro y necesario entender cómo la inflamación y los mecanismos del sistema inmune son dependientes de la microbiota en CCR. Determinar el efecto de la composición de la microbiota intestinal en la tumorogénesis del CCR, así como su efecto en los tratamientos ha de ser verificado en estudios clínicos para futuras aplicaciones.

Debido a las características propias de la población de estudio, donde la prevalencia de bacterias endémicas e infecciones transmisibles es elevada a causa de hábitos sociales y condiciones de higiene, el proyecto propuesto evaluará el conjunto de alteraciones moleculares, las características del tumor en CCR y la composición de la microbiota intestinal, propia de la población peruana, de forma integrativa para definir biomarcadores pronósticos de enfermedad, predictivos de tratamiento y de eventos adversos. Con ello se espera que los pacientes peruanos puedan beneficiarse y ampliar el conocimiento de la enfermedad, pues esta información abrirá nuevas vías para la prevención y estrategias terapéuticas en pacientes con cáncer.

Modalidad de proyecto: Proyecto de investigación avanzado

Los proyectos deben ser presentados de manera asociativa (con una o más entidades asociadas).

La conformación mínima es la siguiente:

• Un investigador principal
• Un coinvestigador
• Un tesista de posgrado
• Un gestor tecnológico
• Un coordinador administrativo

Tipo de proyecto: Investigación aplicada

Subsector: Salud

Sector: General

Lugar de ejecución del proyecto: Lima

Fecha de inicio:  01/12/2018

Fecha de cierre:  01/12/2021

Plazo de ejecución (meses): 36

Objetivo principal

El proyecto de investigación de la presente propuesta se llevará a cabo mediante una metodología clara y reproducible, así como con un análisis comprensivo de la relación entre los resultados obtenidos y las variables clínicas de los pacientes. La realización del proyecto incrementará y estandarizará la experiencia metodológica y de análisis de muestras tumorales con la finalidad de continuar incrementando los niveles de excelencia en investigación en el Perú al respecto del manejo de patología neoplásica y del bienestar y tratamiento de los pacientes. Ello para reducir el cáncer avanzado e incrementar la esperanza de vida. De esta forma, el proyecto pretende, mediante el trabajo en conjunto de un equipo multidisciplinario de profesionales y de la asociación de dos entidades (instituto y universidad), caracterizar el cáncer colorectal en población la peruana. Para ello, se evaluará la composición de la microbiota intestinal, la infección por agentes virales asociados a cáncer EBV y PVH, y las alteraciones moleculares presentes en el tumor. Ello se podrá relacionar e integrar a los resultados para definir biomarcadores pronósticos de enfermedad, predictivos de respuesta al tratamiento y de eventos adversos, con los que los pacientes peruanos podrán beneficiarse y, de este modo, ampliar el conocimiento de la enfermedad y la posibilidad de intervenir de forma directa y rápida en la rutina de la práctica clínica de los pacientes peruanos.

Objetivo específico 1

Caracterización de las alteraciones moleculares en los tumores. Estratificación del cáncer colorrectal en población peruana

Objetivo específico 2

Evaluar la composición de la microbiota intestinal en cáncer colorrectal

Objetivo específico 3

Identificar un perfil pronóstico de marcadores y microbiota en cáncer colorrectal, en población peruana, que favorezca la respuesta al tratamiento

Institución responsable del proyecto

Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN)

RUC: 20514964778

Tipo de entidad: Institutos o Centros de Investigación de régimen público, exceptuando al ITP y sus CITEs

Régimen: Público

Tipo de organización: Sin fines de lucro

Departamento: Lima

Provincia: Lima

Distrito: Surquillo

Dependencias: Departamento de Cirugía de Abdomen, Departamento de Medicina Oncológica, Laboratorio Banco de Tejidos Tumorales

Institución asociada

Universidad Científica del Sur

RUC: 20421239275

Tipo de entidad: Universidades que se encuentren licenciadas o en proceso de licenciamiento por la SUNEDU

Régimen: Público

País: Perú

Departamento: Lima

Provincia: Lima

Distrito: Villa El Salvador

Investigador principal

Nombres: Eduardo Tomas

Apellido paterno: Payet

Apellido materno: Meza

Grado académico: Magister

Nombre del grado académico: Medicina

Entidad: Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN)

Dependencia: Departamento de Cirugía de Abdomen

Coinvestigador

Nombres: Silvia Patricia

Apellido paterno: Neciosup

Apellido materno: Delgado

Grado académico: Doctorado

Entidad: Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN)

Dependencia: Departamento de Medicina Oncológica

Coinvestigador

Nombres: Carolina

Apellido paterno: Belmar

Apellido materno: López

Grado académico: Doctorado

Entidad: Universidad Científica del Sur

Dependencia: Laboratorio de Genética Molecular y Bioquímica

Tesista

Nombres: Tesista no identificado 2

Apellido paterno: –

Apellido materno: –

Tipo de tesis: Maestría

Entidad: Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN)

Tesista

Nombres: Tesista no identificado 2

Apellido paterno: –

Apellido materno: –

Tipo de tesis: Licenciatura

Entidad: Universidad Científica del Sur

Gestor tecnológico

Nombres: Gerson

Apellido paterno: Zapata

Apellido materno: –

Entidad: Universidad Científica del Sur

Coordinador administrativo

Nombres: Karla

Apellido paterno: Oyarce

Apellido materno: Escobedo

Entidad: Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN)

Técnico

Nombres: Manuel Antonio

Apellidos: Chumpitaz La Rosa Sanchez

Entidad: Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN)

Rubros financiables

• Recursos humanos (hasta 50% del monto financiado)

1. Incentivo monetario para el investigador principal y coinvestigadores: no debe sobrepasar el máximo de S/ 2,000 mensuales por investigador.
2. Pago a los tesistas: no debe sobrepasar el máximo de S/ 1,500 mensuales por tesista.
3. Pago al personal técnico o asistente de investigación: no debe sobrepasar el máximo de S/ 1,000 mensuales por técnico.
4. Honorarios o incentivos para un gestor tecnológico: no debe de sobrepasar el máximo de S/. 1,500 mensuales.

• Equipos y bienes duraderos (hasta 20% del monto financiado)

Corresponde a la adquisición de equipos menores para el proyecto de investigación.

• Materiales e insumos

1. Materiales, insumos, reactivos, accesorios, componentes electrónicos o mecánicos, bienes no inventariables.
2. Material bibliográfico, tales como manuales, bases de datos, libros especializados, otros, y/o suscripciones a redes de información (en físico o electrónico).
3. Software especializado para el desarrollo de los proyectos de investigación.

• Viajes

Corresponde a los gastos de viajes relacionados a actividades propias del proyecto de investigación.

Los gastos que aplican para este rubro son los siguientes:

1. Pasajes: terrestres, aéreos, nacionales e internacionales, en clase económica.
2. Viáticos: comprenden los gastos por concepto de alimentación, hospedaje y movilidad (hacia y desde el lugar de embarque), así como el desplazamiento en el lugar donde se realizan las actividades. El concepto de viáticos es aplicable para estancias cuya duración sea menor a los quince (15) días calendario, considerando los topes máximos diarios detallados en el Anexo 2.
3. Manutención: comprenden los gastos de alojamiento, alimentación y movilidad local durante su permanencia en el lugar sede del objeto del beneficio otorgado, o desplazamientos relacionados con el mismo. El concepto de manutención es aplicable siempre que se trate de una estancia cuya duración sea mayor o igual a quince (15) días calendario, considerando los topes máximos diarios detallados en la convocatoria.
4. Seguro de viaje: el seguro es de carácter obligatorio y su valor debe estar de acuerdo al precio de mercado. La cobertura típicamente incluye gastos médicos de emergencia, muerte accidental, invalidez e imprevistos logísticos durante el viaje (retraso de vuelos, demora o pérdida de equipaje, robos, etc.). El precio del seguro puede variar en función a la edad, duración del viaje y el destino. Se puede financiar hasta un máximo de S/ 2,000.

• Servicios de no consultoría.

Corresponde a los gastos de contratación de personas naturales o jurídicas para la ejecución de actividades de índole técnica especializada, consideradas como críticas para lograr el buen resultado del proyecto de investigación: servicios de laboratorio, colección de datos, procesamiento de muestras, análisis y diseño.

• Otros servicios

Corresponde a los gastos de contratación de personas naturales o jurídicas para la ejecución de actividades complementarias del proyecto de investigación, tales como:

1. Actividades de difusión:

1. Gastos de organización de taller de cierre del proyecto.
2. Costo de publicación de artículos en revistas indizadas.

• Costo de inscripción para participar en eventos o para discutir los resultados con personal interesado o calificado.

1. Actividades complementarias de la investigación:

1. Gastos de importación y desaduanaje de materiales, insumos o equipos relacionados al proyecto de investigación que se adquieran en el extranjero.
2. Gastos relacionados a la obtención del título o grado.

• Gastos relacionados a la solicitud de patentes.

1. Gastos de mantenimiento correctivo para los equipos adquiridos u otro equipo de laboratorio que deba usarse en el proyecto.

• Gastos de gestión (hasta 10% del monto financiado)

Corresponde al incentivo monetario para el coordinador administrativo, útiles de oficina y servicios de imprenta.