El estudio de coprolitos de sociedades arqueológicas representa una gran oportunidad para estudiar una composición «inalterada» de la microbiota intestinal. Caral, la civilización más antigua de las Américas, está datada entre los 3000 y 1800 años a.C. El objetivo del estudio es identificar patógenos y genes de resistencia a antibióticos en especímenes humanos antiguos. Al extraer el ADN de los coprolitos, seguido de la caracterización metagenómica, podremos identificar, sobre la base de sus microbiomas intestinales bacterianos y fúngicos, al mismo tiempo que entender, la evolución de estos patógenos, así como iniciar un camino para tratar y prevenir enfermedades causadas por estas bacterias, hongos y virus. Es importante destacar que nuestros resultados sugerirán que la paleomicrobiología puede ser una herramienta poderosa para evaluar la susceptibilidad a enfermedades en poblaciones antiguas y entender los contextos epidemiológicos que se han dado en el tiempo.

En el marco de los estudios bioarqueologicos en Perú y ante la necesidad de establecer estudios de ADN antiguo para conocer diversos aspectos genéticos de poblaciones de sociedades antiguas, sus microorganismos y tipo de alimentación, surge como pregunta de investigación si existen diferencias entre la susceptibilidad genética hacia determinados microorganismos de las poblaciones de Caral, hace cinco mil años, y las poblaciones actuales. En tal sentido, es necesario conocer las implicancias técnicas y metodológicas de establecer un laboratorio móvil de ADN antiguo para la evaluación de muestras, extracción de ADN antiguo y preservación hasta su análisis.

Las estrategias de estudio de patógenos y seres humanos en la antigüedad nos ayudará a entender los problemas actuales de la población peruana. Estudios previos han logrado comparar la microbiota de poblaciones ancestrales en relación a las contemporáneas en el mismo lugar geográfico, inclusive comparando con otras culturas (Santiago-Rodriguez et al., 2017). Asimismo, se ha podido, inclusive, identificar posibles brotes epidémicos de salmonella y de enfermedad de Chagas producido por el Trypanosoma cruzi procedente de muestras de hasta 4000 años de antigüedad (Guhl F et al., 1999)Por otro lado, un estudio reciente los doctores Guio y Lévano, miembros del equipo del presente estudio, ha identificado el proceso de migración y mestizaje del poblador peruano mediante el estudio del genoma de comunidades nativas y mestizas contemporáneas en Perú (Harris et al., 2018). El presente estudio no solo complementaria los hallazgos en relación a este estudio del genoma del poblador peruano, sino que también se plantea nuevas metodologías para el estudio de la microbiota de otras culturas en Perú en relación a las comunidades nativas o mestizas que viven en el mismo lugar.

La metodología de recolección de muestras, extracción de ADN y análisis bioinformático planteada en el presente estudio ha sido evaluada en otros estudios por nuestro colaborador, el doctor Cano, a partir de lo cual se propone que el impacto y aplicabilidad de nuestros resultados y metodología no solo favorecería al desarrollo de la bioarqueología, sino al entendimiento de la genética del poblador peruano, los patógenos de su flora microbiana y el entorno en el que habitaban; al mismo tiempo que  aportará información de patógenos que colonizaban la flora normal de los habitantes de Caral e identificará la resistencia natural adquirida en los habitantes.

Modalidad de proyecto: Proyecto de investigación avanzado

Los proyectos deben ser presentados de manera asociativa (con una o más entidades asociadas).

La conformación mínima es la siguiente:

• Un investigador principal
• Un coinvestigador
• Un tesista de posgrado
• Un gestor tecnológico
• Un coordinador administrativo

• Tipo de proyecto: Investigación Aplicada

  Subsector: Salud

  Sector: General

  Lugar de ejecución del proyecto: Lima

  Fecha de inicio:  01/12/2018

  Fecha de cierre:  01/12/2020

  Plazo de ejecución (meses): 24

  Objetivo principal

  El objetivo principal de nuestro proyecto es identificar patógenos y genes de resistencia a antibióticos en especímenes humanos antiguos, lo cual permitiría entender la evolución de estos patógenos como una forma para tratar y prevenir enfermedades causadas por estas bacterias y virus.

  Objetivo específico 1

  Desarrollar e implementar un laboratorio portátil in situ para la extracción, identificación y análisis de ADN antiguo en restos de la civilización Caral

  Objetivo específico 2

  Identificar genes relacionados a la susceptibilidad y resistencia microbiana en restos de la civilización Caral.

Institución responsable del proyecto

Asociación Latinoamericana de Biotecnología

RUC: 20517297659

Tipo de entidad: Asociaciones privadas que realicen investigación, según su objeto social

Régimen: Privado

Tipo de organización: Sin fines de lucro

Departamento: Lima

Provincia: Lima

Distrito: Lince

Dependencia:s: Laboratorio de Genética y Biología Molecular

Instituciones asociadas

Zona Arqueológica Caral

RUC: 20505982259

Tipo de entidad: Institutos o centros de investigación de régimen público

Régimen: Público

País: Perú

Departamento: Lima

Provincia: Lima

Distrito: La Molina

The Biocollective

Tipo de entidad: Asociaciones de régimen privado

Régimen: Privado

País: Estados Unidos

Ciudad: Denver

Investigador Principal

Nombres: Heinner

Apellido paterno: Guio

Apellido materno: Chunga

Grado académico: Doctorado

Nombre del grado académico: Médico Cirujano

Entidad: Asociación Latinoamericana de Biotecnología

Dependencia: Laboratorio de Genética y Biología Molecular

Coinvestigadores

Nombres: Kelly Susan

Apellido paterno: Lévano

Apellido materno: Najarro

Grado académico: Doctorado

Entidad: Asociación Latinoamericana de Biotecnología

Dependencia: Laboratorio de Genética y Biología Molecular

Nombres: Luis José

Apellido paterno: Jaramillo

Apellido materno: Valverde

Grado académico: Magister

Entidad: Asociación Latinoamericana de Biotecnología

Dependencia: Laboratorio de Genética y Biología Molecular

Nombres: Ruth Martha

Apellido paterno: Shady

Apellido materno: Solís

Grado académico: Doctorado

Entidad: Zona arqueológica Caral

Dependencia: Dirección General

Nombres: Raúl

Apellido paterno: De Jesús

Apellido materno: Cano

Grado académico: Doctor

Entidad: The Biocollective

Dependencia: Chief Scientific Office

Tesista

Nombres: Tesista no identificado 1

Apellido paterno: –

Apellido materno: –

Tipo de tesis: Maestría

Entidad: Asociación Latinoamericana de Biotecnología

Gestor tecnológico

Nombres: Grecia

Apellido paterno: Riva

Apellido materno: –

Entidad: Asociación Latinoamericana de Biotecnología

Coordinador administrativo

Nombres: Rony Franchescoly

Apellido paterno: Castrejón

Apellido materno: Cabanillas

Entidad: Asociación Latinoamericana de Biotecnología

Técnico

Nombres: Elizabeth

Apellidos: Delgado Fernández

Entidad: Asociación Latinoamericana de Biotecnología

Rubros financiables

• Recursos humanos (hasta 50% del monto financiado)

1. Incentivo monetario para el investigador principal y coinvestigadores: no debe sobrepasar el máximo de S/ 2,000 mensuales por investigador.
2. Pago a los tesistas: no debe sobrepasar el máximo de S/ 1,500 mensuales por tesista.
3. Pago al personal técnico o asistente de investigación: no debe sobrepasar el máximo de S/ 1,000 mensuales por técnico.
4. Honorarios o incentivos para un gestor tecnológico: no debe de sobrepasar el máximo de S/. 1,500 mensuales.

• Equipos y bienes duraderos (hasta 20% del monto financiado)

Corresponde a la adquisición de equipos menores para el proyecto de investigación.

• Materiales e insumos

1. Materiales, insumos, reactivos, accesorios, componentes electrónicos o mecánicos, bienes no inventariables.
2. Material bibliográfico, tales como manuales, bases de datos, libros especializados, otros, y/o suscripciones a redes de información (en físico o electrónico).
3. Software especializado para el desarrollo de los proyectos de investigación.

• Viajes

Corresponde a los gastos de viajes relacionados a actividades propias del proyecto de investigación.

Los gastos que aplican para este rubro son los siguientes:

1. Pasajes: terrestres, aéreos, nacionales e internacionales, en clase económica.
2. Viáticos: comprenden los gastos por concepto de alimentación, hospedaje y movilidad (hacia y desde el lugar de embarque), así como el desplazamiento en el lugar donde se realizan las actividades. El concepto de viáticos es aplicable para estancias cuya duración sea menor a los quince (15) días calendario, considerando los topes máximos diarios detallados en el Anexo 2.
3. Manutención: comprenden los gastos de alojamiento, alimentación y movilidad local durante su permanencia en el lugar sede del objeto del beneficio otorgado, o desplazamientos relacionados con el mismo. El concepto de manutención es aplicable siempre que se trate de una estancia cuya duración sea mayor o igual a quince (15) días calendario, considerando los topes máximos diarios detallados en la convocatoria.
4. Seguro de viaje: el seguro es de carácter obligatorio y su valor debe estar de acuerdo al precio de mercado. La cobertura típicamente incluye gastos médicos de emergencia, muerte accidental, invalidez e imprevistos logísticos durante el viaje (retraso de vuelos, demora o pérdida de equipaje, robos, etc.). El precio del seguro puede variar en función a la edad, duración del viaje y el destino. Se puede financiar hasta un máximo de S/ 2,000.

• Servicios de no consultoría.

Corresponde a los gastos de contratación de personas naturales o jurídicas para la ejecución de actividades de índole técnica especializada, consideradas como críticas para lograr el buen resultado del proyecto de investigación: servicios de laboratorio, colección de datos, procesamiento de muestras, análisis y diseño.

• Otros servicios

Corresponde a los gastos de contratación de personas naturales o jurídicas para la ejecución de actividades complementarias del proyecto de investigación, tales como:

1. Actividades de difusión:

1. Gastos de organización de taller de cierre del proyecto.
2. Costo de publicación de artículos en revistas indizadas.

• Costo de inscripción para participar en eventos o para discutir los resultados con personal interesado o calificado.

1. Actividades complementarias de la investigación:

1. Gastos de importación y desaduanaje de materiales, insumos o equipos relacionados al proyecto de investigación que se adquieran en el extranjero.
2. Gastos relacionados a la obtención del título o grado.

• Gastos relacionados a la solicitud de patentes.

1. Gastos de mantenimiento correctivo para los equipos adquiridos u otro equipo de laboratorio que deba usarse en el proyecto.

• Gastos de gestión (hasta 10% del monto financiado)

Corresponde al incentivo monetario para el coordinador administrativo, útiles de oficina y servicios de imprenta.